Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SQLEQ14534 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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