Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms