Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1CQ13936 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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