Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HTR4Q13639 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms