Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms