Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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