Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4Q12950 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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