Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FOXC1Q12948 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXC1Q12948 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXC1Q12948 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXC1Q12948 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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