Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SREBF2Q12772 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SREBF2Q12772 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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