Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC173Q0VFZ6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms