Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK1Q08629 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCK1Q08629 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms