Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4DQ08499 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms