Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLTCQ00610 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms