Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELF3P78545 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELF3P78545 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELF3P78545 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELF3P78545 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms