Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms