Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SH3BGRP55822 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms