Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP9P55211 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP9P55211 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms