Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM1P49642 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms