Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLCP48506 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLCP48506 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLCP48506 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLCP48506 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLCP48506 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLCP48506 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLCP48506 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCLCP48506 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms