Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD4P46934 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms