Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL35P42766 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL35P42766 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms