Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KDM5CP41229 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms