Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FDFT1P37268 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms