Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CSRP3-202ENST00000533783 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD11P31277 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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