Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA7P31268 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms