Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXD10P28358 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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