Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLD1P28340 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLD1P28340 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLD1P28340 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLD1P28340 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms