Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-217ENST00000560570 2321 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MEIS2-201ENST00000314177 2775 ntTSL 28.93□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 34.91□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.178e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.257e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 221.23■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ST3GAL2-205ENST00000567586 557 ntTSL 418.92■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-210ENST00000559236 576 ntTSL 418.12■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-220ENST00000561120 567 ntTSL 418.12■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 NECAB3-221ENST00000607055 554 ntTSL 417.59■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SYNE3-204ENST00000555759 5493 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 CRIPT-202ENST00000486447 1724 ntTSL 516.28■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-212ENST00000559484 548 ntTSL 416.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-219ENST00000561080 5407 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-207ENST00000464489 5901 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ST3GAL2-203ENST00000561708 581 ntTSL 412.98□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-214ENST00000559664 5111 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 STK24-205ENST00000444574 1590 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-213ENST00000559523 4454 ntTSL 511.7□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC38A11-201ENST00000303735 3737 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-201ENST00000242067 4027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MYLK-217ENST00000514623 3108 ntTSL 29.64□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-207ENST00000433714 3705 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -13e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-202ENST00000350941 3899 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC38A11-210ENST00000493887 577 ntTSL 48.52□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 CRIPT-201ENST00000238892 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-10■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.173e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SERPINA3-205ENST00000485588 575 ntTSL 1 (best)7.25□□□□□ -1.253e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.33e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MPZL1-202ENST00000367853 881 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.393e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MPZL1-208ENST00000474729 1335 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.423e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.423e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-208ENST00000434373 1982 ntTSL 1 (best)6.08□□□□□ -1.443e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MPZL1-204ENST00000403379 961 ntTSL 55.13□□□□□ -1.593e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ARHGAP32-207ENST00000533509 1064 ntTSL 1 (best)4.85□□□□□ -1.633e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 NLK-202ENST00000496808 1702 ntTSL 24.83□□□□□ -1.643e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 MRPL22-204ENST00000519059 511 ntTSL 24.71□□□□□ -1.663e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.723e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.773e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC12A6-217ENST00000560332 490 ntTSL 33.75□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-217ENST00000483421 2076 ntTSL 23.56□□□□□ -1.843e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 BBS9-214ENST00000496029 650 ntTSL 23.36□□□□□ -1.873e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-221ENST00000488126 842 ntTSL 23.19□□□□□ -1.93e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-224ENST00000493576 1107 ntTSL 53.08□□□□□ -1.923e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.923e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 SLC38A11-205ENST00000424914 452 ntTSL 53.02□□□□□ -1.933e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-208ENST00000637337 7179 ntTSL 1 (best)2.98□□□□□ -1.933e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-202ENST00000361302 7179 ntTSL 1 (best)2.98□□□□□ -1.933e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 PHACTR4-208ENST00000633167 553 ntTSL 52.7□□□□□ -1.983e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-211ENST00000461991 846 ntTSL 32.65□□□□□ -1.993e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-215ENST00000472758 535 ntTSL 32.51□□□□□ -2.013e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-219ENST00000487638 4233 ntTSL 1 (best)2.12□□□□□ -2.073e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.093e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 ZNF638-202ENST00000409407 4470 ntTSL 21.94□□□□□ -2.13e-8■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 46.39□□□□□ -1.396e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 VPS72-202ENST00000368892 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.316e-14■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 VPS72-201ENST00000354473 1347 ntTSL 314.46□□□□□ -0.096e-14■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 VPS72-205ENST00000491094 4267 ntTSL 510.26□□□□□ -0.776e-14■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 LPP-213ENST00000471917 998 ntTSL 38.71□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 27.8
PTBP1P26599 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 217.3 ms