Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YY1P25490 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YY1P25490 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YY1P25490 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YY1P25490 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YY1P25490 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YY1P25490 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YY1P25490 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YY1P25490 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YY1P25490 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YY1P25490 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YY1P25490 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YY1P25490 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YY1P25490 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YY1P25490 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YY1P25490 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YY1P25490 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YY1P25490 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YY1P25490 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms