Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR2AP24928 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms