Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFSF4P23510 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms