Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRGP23470 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
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