Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KB1P23443 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms