Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NF1P21359 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NF1P21359 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NF1P21359 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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