Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD58P19256 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD58P19256 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD58P19256 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD58P19256 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD58P19256 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD58P19256 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD58P19256 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD58P19256 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD58P19256 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD58P19256 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD58P19256 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms