Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VEGFAP15692 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms