Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms