Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMBP08118 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMBP08118 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMBP08118 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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