Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD4O95243 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MBD4O95243 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD4O95243 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD4O95243 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD4O95243 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD4O95243 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD4O95243 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD4O95243 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD4O95243 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD4O95243 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms