Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN7O94888 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms