Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB11FIP3O75154 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms