Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms