Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX15O60248 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms