Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms