Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRPF3O43395 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms