Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms