Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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