Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E9PCH4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E9PCH4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
E9PCH4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E9PCH4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E9PCH4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E9PCH4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E9PCH4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms