Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP17L13C9JLJ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms