Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SOBPA7XYQ1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOBPA7XYQ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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